藥劑師考試科目分為藥學類和中藥學類兩大類,。藥學類包括藥事管理與法規(guī)、藥學專業(yè)知識(一),、藥學專業(yè)知識(二)和藥學綜合知識與技能,，而中藥學類則包括藥事管理與法規(guī)、中藥學專業(yè)知識(一),、中藥學專業(yè)知識(二)和中藥學綜合知識與技能,。藥學類和中藥學類的共同科目是藥事管理與法規(guī)。

在藥學類中,，藥學專業(yè)知識(一)主要考察考生在藥劑學,、藥物化學、藥效學和藥物分析方面的知識,；而藥學專業(yè)知識(二)則主要考察考生在臨床藥物治療學和臨床藥理學方面的知識,。藥學綜合知識與技能則是對考生全面綜合應用所學知識的考察。

在中藥學類中,，中藥學專業(yè)知識(一)主要考察考生在中藥學,、中藥化學、中藥炮制學,、中藥藥劑學,、中藥藥理學和中藥鑒定學方面的知識；而中藥學專業(yè)知識(二)則主要考察考生在臨床中藥學,、中成藥學和方劑學方面的知識,。中藥學綜合知識與技能則是對考生全面綜合應用所學知識的考察,。

每科試卷滿分為120分，各科單獨計分,，單獨考試。只有通過所有科目的考試,，并取得及格以上的成績,，才能獲得國家執(zhí)業(yè)藥師資格證書。